耶拿大学很差么？
是，与海德堡大学相对，诞生伊始的耶拿大学，虽然因为弗里德里希·席勒的关系，人文学院有着一定的底蕴，但是在自然科学领域，却是一穷二白，所以有德国人戏称，“海德堡大学的学生都只上人文课，而耶拿大学的学生都只上自然课”，所以两所大学的学生互有偏见。
但是，从19世纪中后期开始，耶拿大学开始大兴土木，除了在人文学科领域，大力引进人才，开始兴盛外，也开始在自然科学领域努力发展，最终，成为了德国的教育中心，19世纪和20世纪之交，被称为耶拿大学史上“金色”的年代，在此期间，该大学的师生们荣获五次诺贝尔奖。
二战后，由于德意志民主共和国的成立，耶拿大学获得了更加充足和丰富的资源，开始真正成为了一所学科门类齐全的现代大学。